Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP1R9BQ96SB3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPP1R9BQ96SB3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R9BQ96SB3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms