Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP5Q96RT8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP5Q96RT8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms