Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HHIPQ96QV1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HHIPQ96QV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms