Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC9Q96Q05 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC9Q96Q05 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC9Q96Q05 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms