Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSGA13Q96PP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSGA13Q96PP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSGA13Q96PP4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms