Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARAP1Q96P48 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARAP1Q96P48 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARAP1Q96P48 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARAP1Q96P48 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
ARAP1Q96P48 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARAP1Q96P48 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms