Protein–RNA interactions for Protein: Q96N06

SPATA33, Spermatogenesis-associated protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA33Q96N06 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA33Q96N06 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPATA33Q96N06 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA33Q96N06 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms