Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROBO3Q96MS0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROBO3Q96MS0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms