Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP57Q96MR6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms