Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD1Q96MG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms