Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC138Q96M89 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC138Q96M89 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms