Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC7Q96M83 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC7Q96M83 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms