Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1LQ96KA5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1LQ96KA5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms