Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXL4Q96JB6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LOXL4Q96JB6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms