Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MS4A3Q96HJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms