Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BICD1Q96G01 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BICD1Q96G01 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BICD1Q96G01 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms