Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms