Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms