Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDC3Q96F86 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC3Q96F86 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC3Q96F86 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms