Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF21BQ96EK2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF21BQ96EK2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF21BQ96EK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms