Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYTL4Q96C24 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYTL4Q96C24 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYTL4Q96C24 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYTL4Q96C24 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYTL4Q96C24 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYTL4Q96C24 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYTL4Q96C24 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SYTL4Q96C24 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms