Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC74AQ96AQ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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