Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VTI1AQ96AJ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms