Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYAP1Q96A49 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYAP1Q96A49 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYAP1Q96A49 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms