Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35B4Q969S0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35B4Q969S0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms