Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHMTQ93088 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms