Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX13Q92968 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms