Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FRAT1Q92837 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FRAT1Q92837 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRAT1Q92837 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms