Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX1Q92786 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms