Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATAD2BQ8WXI9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATAD2BQ8WXI9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms