Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms