Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CASKIN1Q8WXD9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CASKIN1Q8WXD9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms