Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CREB3L4Q8TEY5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB3L4Q8TEY5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms