Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX29Q8TEQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX29Q8TEQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX29Q8TEQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 981.8 ms