Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD5Q8TDI0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD5Q8TDI0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms