Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGR3Q8TD06 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms