Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GADD45GIP1Q8TAE8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms