Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP61Q8NHU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP61Q8NHU2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP61Q8NHU2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms