Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP35Q8NFH5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms