Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEH6

MNS1, Meiosis-specific nuclear structural protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNS1Q8NEH6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MNS1Q8NEH6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MNS1Q8NEH6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MNS1Q8NEH6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms