Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND6BQ8NEG7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND6BQ8NEG7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND6BQ8NEG7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms