Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD4Q8NCY6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD4Q8NCY6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSANTD4Q8NCY6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms