Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARRDC4Q8NCT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARRDC4Q8NCT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms