Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APCDD1LQ8NCL9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APCDD1LQ8NCL9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
APCDD1LQ8NCL9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APCDD1LQ8NCL9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APCDD1LQ8NCL9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms