Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1BQ8NB78 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM1BQ8NB78 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM1BQ8NB78 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms