Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC5Q8NAU1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC5Q8NAU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms