Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf106Q8NAJ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf106Q8NAJ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms