Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TTLL6Q8N841 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTLL6Q8N841 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL6Q8N841 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms