Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR7Q8N806 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms