Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBL4BQ8N7F7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL4BQ8N7F7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms